TFF 1’inci Lig ekiplerinden Altınordu’dan Beşiktaş’a transfer olan Atakan Üner Beşiktaş’a transfer oldu. Denizlispor altyapısından yetişen ve 2018 yılı yaz transfer döneminde yeterli forma şansı bulamadığı için sözleşmesini fesh eden Üner, Altınordu’ya transfer olmuştu. İzmir temsilcisinde 55 maça çıkan Üner, 7 gol ve 8 asistlik performans sergiledi. İki yıl Altınordu’da forma giydikten sonra Beşiktaş’a 150 bin Euro bonservis bedeliyle transfer oldu. Atakan’ın bir sonraki satışından kırmızı-lacivertliler yüzde 20 pay alacak. Atakan’ın siyah-beyazlı kulüple 3 yıllık sözleşme imzalayacağı bildirildi.
2018 yılında TFF 1. Lig 4. Hafta mücadelesinde Altınordu ve Denizlispor’un karşı karşıya geldiği maçta Hüseyin Atakan Üner yetiştiği kulübün taraftarından tepki almıştı. Üner, maçta attığı golün ardından Denizlspor taraftarının bulunduğu tribün önüne giderek abartılı bir sevinç sergileyince Denizlispor taraftarı Atakan’a tepki gösterdi.